近期，国家税务总局青岛自贸片区税务局接到风控核查任务，需核实某石油装备公司在先进制造业企业增值税加计抵减、研发费用加计扣除及买卖合同印花税申报方面存在的三项疑点。该局运用“内部数据深挖+外部数据联动+多维组合验证”的三步工作法，逐项破解难题。

在印花税核查环节，风控人员依托系统内部数据，对企业取得和开具的经营商品发票金额、同期申报的印花税计税依据，以及同行业企业缴纳情况进行三维比对，初步锁定少缴疑点。经进一步辅导，企业补缴印花税税款及滞纳金合计38万余元。

针对加计抵减疑点，核查人员通过外部辅助软件梳理企业风险期内进项发票，发现同一控制方下的两户企业向其开具了进项发票。根据政策规定，此类关联交易产生的进项税额不得计提加计抵减额。风控人员逐期核对企业进项明细与内销收入占比，确认2025年4月至2026年3月期间，企业取得相关进项税额合计690万元。税务干部逐期计算应调减的加计抵减额，最终辅导企业更正增值税申报表，调减留抵税额7万余元。

在研发费用加计扣除方面，核查人员采取资料核实与问询相结合的方式，调取企业高新技术认定材料、项目立项文件、研发辅助账、记账凭证及审计报告等，系统梳理研发项目开展情况及费用归集标准。核查发现，2023年度企业存在30余万元“其他业务收入”，实为研发试生产产品销售收入，按规定应作为特殊收入申报并调减加计扣除基数，但企业未准确申报。经辅导，企业补缴该年度企业所得税及滞纳金6.7万元。